La Comunidad Autónoma de Canarias inicio la gestión de los fondos comunitarios destinados a la pesca en 1994 (Marco 1994-1999). Bajo la denominación de Instrumento Financiero de Orientación de la Pesca (I.F.O.P.), este fondo, entonces estructural, cofinanció los programas operativos nacionales, de carácter pluriregional, y en este periodo se puso el acento en actuaciones de desguace de la flota obsoleta y la potenciación de la misma en forma de unidades nuevas (Nueva Construcción) y la modernización de otras. Paralelamente se realizaron fuertes inversiones en Industrias Pesqueras de Comercialización y Transformación y se atendieron las primeras iniciativas en acuicultura. El programa se cerro junto con la finalización y no renovación del acuerdo pesquero entre la Comunidad Europea y Marruecos, hecho que tuvo una importancia capital para el sector pesquero en canarias y que marco el inicio de un constante declive.
Los datos resultantes de esta intervención son los que se indican a continuación: